Добавляйте коды счётчиков в файл /templates/шаблон/index.html, вниз, либо на Ваше усмотрение.
Примечание
Если выводится ошибка в магазине после того, как Вы добавили коды счётчиков, попробуйте заключить код счётчиков в: {literal}коды счётчиков{/literal}